Es una de las regiones más biodiversas del mundo.​ En el Manu es posible encontrar toda la variedad de pisos ecológicos que existen en la Amazonia y esto la hace una de las áreas protegidas más apreciadas. En una sola hectárea se han llegado a encontrar hasta 250 especies de árboles​. En la Reserva de la Biósfera de Manu se han registrado 223 especies de mamíferos y 1005 de aves.​ También tiene el récord mundial de diversidad de especies de anfibios (155) y reptiles (132) para un área protegida.

Parque nacional del Manu

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